本学科的主要研究方向包括：农产品质量安全监测评估与品质评价、真菌毒素研究、农药安全性评价、产地环境污染物评价与溯源、微生物评价、植物新品种测试。依据上海特大型国际化城市对农产品质量安全管理的科技需求，立足上海、服务全国，以风险评估能力提升为核心，将上海市农业科学院农产品质量标准与检测技术研究所打造成一个研究特色鲜明、研究水平国内一流、综合实力具有国际影响力的农产品质量安全科技创新中心。同时搭建一个农产品质量安全国际交流的窗口，打造一个全国知名农产品质量安全服务机构。

主持及参与国家级项目21项，省部级项目157项，累计经费  6187万元。共发表科技论文312篇（其中SCI80篇，影响因子达235.714）；申请发明专利61项，获得授权专利23项；制定国家标准33项，行业标准21项；参与编写专著、论著19本；获国家级标准物质证书8项；获软件著作权4项；主持及参与获得上海市科学技术进步三等奖2项、神农中华农业科技奖1项。近年来重点研究抗生素耐药菌、二噁英、真菌毒素、农药等热点和焦点问题。

学科团队拥有杰出青年农业科学家1人，闵行区领军人才2人，上海市青年拔尖人才1人， 1人入选上海市浦江人才计划，2人入选科技创新行动扬帆计划，1人入选上海市青年科技启明星计划，1人获得上海市青年五四奖章。